TABLE 3

Interference for nine intervals taken pairwise

Setade5,7-URA3URA3-KANKAN-lys5lys5-NATNAT-HYGHYG-cyh2cyh2-crl3crl3-trp5
A. trp5-leu1
ITT + NPD 280:217:5
 (24.6 ± 1.7) 319:180:3
 (19.7 ± 1.4) 318:212:1
 (20.5 ± 1.2) 398:137:1
 (13.3 ± 1.1) 455:86:0
 (8.0 ± 0.8) 467:70:3
 (8.2 ± 1.2) 233:303:5
 (30.8 ± 1.5) 473:69:0
 (6.4 ± 0.7)
PD 792:607:9
 (23.5 ± 0.9) 810:572:12
 (23.1 ± 1.0) 909:562:4
 (19.9 ± 0.7)1070:417:5
 (15.0 ± 0.7)1258:244:0
 (8.1 ± 0.5)1372:168:3
 (6.0 ± 0.5)605:861:35
 (35.7 ± 1.2) 727:773:13
 (28.1 ± 0.9)
χ2 P0.720.100.510.280.920.150.09<0.0001
Sig. SE (cM)NoNoNoNoNoNoYesYes
IITT + NPD 130:323:22
 (47.9 ± 2.7) 292:177:3
 (20.7 ± 1.5) 294:177:2
 (19.9 ± 1.4) 392:87:0
 (9.1 ± 0.9) 379:102:2
 (11.8 ± 1.3) 172:302:8
 (36.3 ± 1.9) 395:85:3
 (10.7 ± 1.4)
PD 230:641:55
 (52.4 ± 2.2) 562:351:8
 (21.7 ± 1.2) 575:340:9
 (21.3 ± 1.2) 783:143:2
 (8.4 ± 0.7) 764:162:2
 (9.4 ± 0.8) 313:575:40
 (43.9 ± 1.9) 441:482:10
 (29.1 ± 1.2)
χ2 P0.400.870.540.250.090.03<0.0001
Sig. SE (cM)NoNoNoNoNoYesYes
Setade5,7-URA3URA3-KANKAN-lys5lys5-NATNAT-HPHHPH-cyh2cyh2-crl3trp5-leu1
B. crl3-trp5
ITT + NPD 446:344:7
 (24.2 ± 1.3) 485:295:6
 (21.1 ± 1.2) 504:326:3
 (20.7 ± 1.0) 614:229:0
 (13.6 ± 0.8) 712:137:0
 (8.1 ± 0.6) 742:104:1
 (6.5 ± 0.7) 465:376:11
 (25.9 ± 1.4) 786:68:1
 (4.3 ± 0.6)
PD 622:479:7
 (23.5 ± 1.0) 644:454:9
 (22.9 ± 1.1) 721:447:2
 (19.6 ± 0.8) 848:325:6
 (15.3 ± 0.9) 994:194:0
 (8.2 ± 0.5)1046:135:5
 (7.0 ± 0.7) 375:789:29
 (40.4 ± 1.4) 727:470:3
 (20.3 ± 0.8)
χ2 P0.820.300.640.691.00.74<0.0001<0.0001
Sig. SE (cM)NoNoNoNoNoNoYesYes
IITT + NPD 138:394:39
 (55.0 ± 2.9) 354:212:4
 (20.7 ± 1.4) 353:212:5
 (21.2 ± 1.5) 474:96:1
 (8.9 ± 0.9) 477:94:1
 (8.7 ± 0.9) 266:300:11
 (31.7 ± 1.9) 492:88:0
 (7.6 ± 0.7)
PD 220:566:38
 (48.2 ± 2.1) 499:312:7
 (21.6 ± 1.2) 511:305:6
 (20.7 ± 1.2) 696:134:1
 (8.4 ± 0.7) 665:167:3
 (11.1 ± 0.9) 223:579:38
 (48.0 ± 2.0) 441:389:6
 (25.4 ± 1.2)
χ2 P0.150.880.950.760.09<0.0001<0.0001
Sig. SE (cM)NoNoNoNoNoYesYes
Setade5,7-URA3URA3-KANKAN-lys5lys5-NATNAT-HPHHPH-cyh2crl3-trp5trp5-leu1
C. cyh2-crl3
ITT + NPD 617:492:5
 (23.4 ± 0.9) 636:465:11
 (23.9 ± 1.1) 742:443:1
 (18.9 ± 0.7) 876:314:4
 (14.2 ± 0.8)1047:154:0
 (6.4 ± 0.5)1110:92:4
 (4.8 ± 0.6) 818:382:4
 (16.9 ± 0.8) 895:306:2
 (13.2 ± 0.7)
PD 452:328:9
 (24.2 ± 1.4) 495:281:4
 (19.6 ± 1.1) 482:329:4
 (21.7 ± 1.1) 585:239:2
 (15.2 ± 0.9) 659:175:0
 (10.5 ± 0.7) 687:148:2
 (9.6 ± 0.8) 375:456:9
 (30.4 ± 1.3) 605:231:2
 (14.5 ± 0.9)
χ2 P0.130.020.130.23<0.0001<0.0001<0.00010.30
Sig. SE (cM)NoYes (neg.)YesNoYesYesYesNo
IITT + NPD 247:629:45
 (48.8 ± 2.0) 578:328:9
 (20.9 ± 1.2) 577:327:9
 (20.9 ± 1.2) 782:140:2
 (8.2 ± 0.7) 792:137:3
 (8.3 ± 0.8) 617:300:11
 (19.7 ± 1.3) 615:306:4
 (17.8 ± 1.0)
PD 114:334:32
 (54.8 ± 3.1) 276:201:2
 (22.2 ± 1.4) 291:192:2
 (21.0 ± 1.4) 395:89:0
 (9.2 ± 0.9) 358:128:1
 (13.8 ± 1.2) 223:264:2
 (28.2 ± 1.4) 313:170:2
 (18.8 ± 1.4)
χ2 P0.220.0510.220.17<0.0001< 0.00010.50
Sig. SE (cM)NoNoNoNoYesYesNo
D. HPH-cyh2
ITT + NPD 125:103:0
 (22.6 ± 1.7) 142:82:3
 (22.0 ± 2.7) 169:72:1
 (16.1 ± 1.9) 195:49:0
 (10.0 ± 1.3) 232:13:0
 (2.7 ± 0.7) 150:91:5
 (24.6 ± 3.0) 140:105:0
 (21.4 ± 1.6) 171:73:0
 (15.0 ± 1.5)
PD 944:715:13
 (23.7 ± 0.9) 986:661:12
 (22.1 ± 0.8)1051:699:4
 (20.6 ± 0.7)1264:504:6
 (15.2 ± 0.7)1482:316:0
 (8.8 ± 0.5) 687:1075:35
 (35.8 ± 1.1)1046:729:13
 (22.6 ± 0.8)1327:463:4
 (13.6 ± 0.6)
χ2 P0.340.380.010.01<0.0001<0.00010.350.23
Sig. SE (cM)NoNoYesYesYesYesNoNo
IITT + NPD  76:174:16
 (50.6 ± 4.1) 152:113:3
 (24.4 ± 2.3) 191:76:2
 (16.4 ± 2.0) 245:25:1
 (5.7 ± 1.4) 129:135:5
 (30.7 ± 2.7) 170:94:1
 (18.9 ± 1.8) 164:103:1
 (20.3 ± 1.8)
PD 287:792:60
 (50.6 ± 1.9) 701:421:8
 (20.8 ± 1.0) 681:442:9
 (21.9 ± 1.0) 943:206:1
 (9.2 ± 0.6) 358:747:45
 (44.2 ± 1.7) 665:466:11
 (23.3 ± 1.1) 764:374:5
 (17.7 ± 0.9)
χ2 P0.430.240.0040.001<0.00010.160.09
Sig. SE (cM)NoNoYesYesYesYesNo
Setade5,7-URA3URA3-KANKAN-lys5lys5-NATHPH-cyh2cyh2-crl3crl3-trp5trp5-leu1
E. NAT-HPH
ITT + NPD 168:140:4
 (26.3 ± 2.3) 198:111:2
 (19.8 ± 1.9) 224:99:1
 (16.2 ± 1.6) 290:37:0
 (5.7 ± 0.9) 316:11:2
 (3.5 ± 1.4) 175:150:4
 (26.4 ± 2.2) 194:135:2
 (22.2 ± 1.8) 244:85:1
 (13.8 ± 1.5)
PD 904:678:9
 (23.0 ± 0.8) 931:636:13
 (22.6 ± 0.9) 999:675:4
 (20.8 ± 0.7)1179:519:6
 (16.3 ± 0.7)1482:228:4
 (7.4 ± 0.5) 659:1011:36
 (36.0 ± 1.1) 994:701:11
 (22.5 ± 0.8)1258:452:3
 (13.7 ± 0.6)
χ2 P0.260.290.002<0.0001<0.0001<0.00010.990.92
Sig. SE (cM)NoNoYesYesYesYesNoNo
IITT + NPD  65:156:12
 (48.9 ± 4.1) 142:89:2
 (21.7 ± 2.3) 197:36:2
 (10.2 ± 2.1) 207:26:0
 (5.6 ± 1.0) 89:129:13
 (44.8 ± 4.4) 135:92:5
 (26.3 ± 3.1) 145:85:2
 (20.9 ± 2.3)
PD 296:810:64
 (51.0 ± 1.9) 708:445:9
 (21.5 ± 1.0) 680:485:9
 (23.0 ± 1.0) 943:241:4
 (11.2 ± 0.8) 395:746:36
 (40.9 ± 1.5) 696:467:7
 (21.8 ± 1.0) 783:388:4
 (17.5 ± 0.8)
χ2 P0.710.99<0.00010.0010.03 (neg.)0.060.25
Sig. SE (cM)NoNoYesYesNoNoNo
Setade5,7-URA3URA3-KANKAN-lys5NAT-HPHHPH-cyh2cyh2-crl3crls3-trp5trp5-leu1
F. lys5-NAT
ITT + NPD 291:219:3
 (23.1 ± 1.4) 321:187:4
 (20.6 ± 1.5) 475:81:2
 (8.3 ± 1.1) 525:37:0
 (3.3 ± 0.5) 510:48:1
 (4.8 ± 0.8) 241:306:12
 (33.8 ± 2.0) 331:225:4
 (22.2 ± 1.4) 422:137:1
 (12.8 ± 1.0)
PD 776:591:10
 (23.6 ± 0.9) 795:560:11
 (22.9 ± 1.0) 754:697:3
 (24.6 ± 0.7)1179:290:0
 (9.9 ± 0.5)1264:191:4
 (7.4 ± 0.6) 585:850:26
 (34.4 ± 1.1) 848:607:7
 (22.2 ± 0.8)1070:395:3
 (14.1 ± 0.7)
χ2 P0.940.21<0.0001<0.00010.0060.360.720.28
Sig. SE (cM)NoNoYesYesYesNoNoNo
IITT + NPD 125:372:30
 (52.4 ± 2.8) 406:122:3
 (13.2 ± 1.3) 494:36:2
 (4.5 ± 1.0) 451:77:1
 (7.8 ± 1.0) 194:319:17
 (39.7 ± 2.3) 311:213:4
 (22.4 ± 1.5) 349:177:2
 (17.9 ± 1.3)
PD 231:590:46
 (49.9 ± 2.1 452:414:8
 (26.4 ± 1.2) 680:197:0
 (11.2 ± 0.7) 681:188:3
 (11.8 ± 0.9) 291:547:30
 (41.9 ± 1.8) 511:344:9
 (23.0 ± 1.3) 575:290:4
 (18.1 ± 1.0)
χ2 P0.47<0.0001<0.00010.0010.500.861.0
Sig. SE (cM)NoYesYesYesNoNoNo
G. KAN-lys5
ITT + NPD 407:312:4
 (23.2 ± 1.2) 521:203:3
 (15.2 ± 1.1) 700:81:2
 (5.9 ± 0.8) 679:100:0
 (6.4 ± 0.6) 703:72:1
 (5.0 ± 0.6) 333:428:16
 (33.7 ± 1.6) 449:325:4
 (22.4 ± 1.1) 566:213:0
 (13.7 ± 0.8)
PD 648:490:8
 (23.5 ± 1.0) 598:548:12
 (26.8 ± 1.1) 809:767:9
 (25.9 ± 0.8) 999:224:0
 (9.2 ± 0.6)1051:166:3
 (7.5 ± 0.6) 482:720:22
 (34.8 ± 1.2) 721:497:7
 (22.0 ± 0.9) 909:315:3
 (13.6 ± 0.7)
χ2 P0.92<0.0001<0.00010.0020.0040.250.860.51
Sig. SE (cM)NoYesYesYesYesNoNoNo
IITT + NPD 173:350:23
 (44.7 ± 2.5) 422:121:4
 (13.3 ± 1.4) 454:91:0
 (8.4 ± 0.8) 429:113:3
 (12.0 ± 1.3) 203:319:18
 (39.5 ± 2.3) 319:207:9
 (24.4 ± 1.9) 359:178:2
 (17.6 ± 1.3)
PD 186:619:53
 (54.6 ± 2.3) 452:399:7
 (25.7 + 1.2) 708:140:2
 (8.9 ± 0.8) 701:151:1
 (9.2 ± 0.7) 276:548:30
 (42.6 ± 1.9) 499:350:4
 (21.9 ± 1.1) 562:288:4
 (18.3 ± 1.0)
χ2 P< 0.0001<0.00011.00.120.130.060.81
Sig. SE (cM)YesYesNoNoNoNoNo
Setade5,7-URA3KAN-lys5lys5-NATNAT-HPHHPH-cyh2cyh2-crl3crl3-trp5trp5-leu1
H. URA3-KAN
ITT + NPD 525:234:4
 (16.9 ± 1.1) 560:204:2
 (14.1 ± 1.0) 571:190:1
 (12.9 ± 0.9) 649:113:0
 (7.4 ± 0.6) 673:83:2
 (6.3 ± 0.8) 285:461:15
 (36.2 ± 1.6) 463:295:6
 (21.7 ± 1.3) 584:182:1
 (12.3 ± 0.9)
PD 541:580:9
 (28.1 ± 1.0) 598:519:2
 (23.7 ± 0.8) 795:316:5
 (15.5 ± 0.9) 931:198:0
 (8.8 ± 0.6) 986:139:3
 (7.0 ± 0.7) 495:613:23
 (33.2 ± 1.4) 644:479:6
 (22.8 ± 1.0) 810:317:2
 (14.6 ± 0.8)
χ2 P<0.0001<0.00010.090.130.410.020.220.04
Sig. SE (cM)YesYesYesNoNoNo (neg.)NoYes
SetKAN-lys5lys5-NATNAT-HPHHPH-cyh2cyh2-cl3crl3-trp5trp5-leu1
I. ade5,7-KAN
IITT + NPD 672:365:8
 (19.8 ± 1.1) 636:394:8
 (21.3 ± 1.1) 874:168:0
 (8.1 ± 0.6) 852:187:3
 (9.8 ± 0.8) 366:639:35
 (40.8 ± 1.7) 604:423:10
 (23.3 ± 1.1) 696:340:5
 (17.8 ± 1.0)
PD 186:170:3
 (26.2 ± 1.9) 231:122:3
 (19.7 ± 1.9) 296:63:2
 (10.4 ± 1.5) 287:75:1
 (11.2 ± 1.3) 114:233:14
 (43.9 ± 3.0) 220:135:3
 (21.4 ± 1.9) 230:129:1
 (18.8 ± 1.5)
χ2 P0.00010.460.450.290.440.570.34
Sig. SE (cM)YesNoNoNoNoNoNo
SetURA3-KANKAN-lys5lys5-NATNAT-HPHHPH-cyh2cyh2-cl3crl3-trp5trp5-leu1
J. ade5,7-URA3
ITT + NPD 589:233:4
 (15.6 ± 1.0) 498:315:1
 (19.7 ± 0.9) 601:222:0
 (13.5 ± 0.8) 687:144:0
 (8.7 ± 0.7) 728:100:3
 (7.1 ± 0.8) 336:478:19
 (35.5 ± 1.6) 485:348:3
 (21.9 ± 1.0) 615:220:2
 (13.9 ± 0.9)
PD 541:515:10
 (27.0 ± 1.1) 648:404:3
 (20.0 ± 0.9) 776:286:5
 (14.8 ± 0.9) 904:168:0
 (7.8 ± 0.6) 944:122:3
 (6.6 ± 0.7) 452:599:18
 (33.1 ± 1.3) 622:437:9
 (23.0 ± 1.1) 792:278:2
 (13.5 ± 0.8)
χ2 P<0.00011.00.920.370.690.490.410.89
Sig. SE (cM)YesNoNoNoNoNoNoNo