TABLE 5

Gene targeting rates

GeneFlyBaseSiteArmBG rateKG rateEY rateEP ratePA/PC
 rate
KG hotspots (22F–23A)
CG989423A32L209961945 0
CG16987Alp23B23B12L 0 8910 5 0
CG9884oaf22F32L 0 9515 0 0
CG3539Slh22F32L 0 24 0 0 0
CG310423B52L 0 21 1 0 0
CG31690CG3169023A22L 0 16 0 0 0
KG hotspots (38B–44A)
CG8676Hr3939B42L35246151020
CG11546l(2)0204544B72R15136 4 5 0
CG870944B52R 0 96 8 5 0
CG31611/
   CG3161339E12L 0 8011 0 0
CG867839B32L 0 45 3 0 0
CG8677BEST:LD1495939B32L 0 39 1 5 0
CG15845Adf142C32R 0 34 810 0
CG3162639B42L 5 29 1 010
CG2163Pabp244B42R 0 28 4 5 0
CG12110Pld42A152R 0 26 5 0 0
CG9243/
   CG9244Acon39A72L 0 21 1 0 0
CG10718neb38B42L 5 19 5 5 0
CG10746fok38B42L 5 19 5 0 0
KG hotspots (49B–F)
CG4654Dp49F102R 0 38 5 5 0
CG467049F112R 0 24 0 0 0
CG466349F112R 0 13 0 010
EY/EP/BG hotspots (85C–91F)
CG9429Crc850E13R55  53125 0
CG10120Men87C63R15  94630 0
CG5555/
   CG3147591F113R 0  82960 0
CG1103385C33R15  43035 0
CG3937cher89E133R40  520 5 0
CG9366RhoL85D183R 0  51615 0
EY/EP/BG hotspots (misc)
CG5723Ten-m79E13L10 103310 0
CG5320Gdh95C133R 5  62915 0
CG3979Indy75E13L 0  52810 0
CG14450/
   CG1136780A13L 5  621 0 0
CG3152282B43R 5  118 5 0
PA/PC hotspots
CG921614A9X 0  5 4 050
CG1430791A83R 0  3 4 040
Common hotspots
CG31243cpo90D13R90 14566010
CG8276bin342A142R60 8730 040
CG17161grp36A102L45 25204550
CG12052lola47A112R55 181375 0
CG6889tara89B133R25 13345030
CG8938GstS153F92R25 11295530
CG32529/
   amnamn18F4X10 484150 0
CG9755pum85C43R35 19204030
CG3758esg35D12L75 101535 0
CG14709BEST:CK012286E143R30 195530 0
CG8846Thor23F62L10 442440 0
CG3696kis21B62L15 19214510
CG1228472D13L20  9132540
CG3903Gli35D42L10 29292510
CG1856ttk100D13R30 26181510
CG7437mub79A23L35  62335 0
CG31000heph100D43R20 14282010
CG10645lama64D13L20  8292510
CG9432l(2)0128942C72R 5 304110 0
CG8651trx88B13R15 18251510
CG5393apt59F12R 0 303510 0
CG17950HmgD57F102R20 2026 5 0
CG17716fas50B62R15 3613 5 0
CG6072sra89B123R 0 1626 520
CG7481/
   CG7582RhoGAP18B18A3X 0 242415 0
CG303625B12L 0 251620 0
CG5461bun33E52L10 211315 0
CG8804wun45D42R 5 21 920 0
CG10033for24A22L 0 2623 5 0
CG2922eIF-5C83B1-23R 5  3151510
CG8815Sin3A49B62R 0 13 42010
  • Mutation rates are in hits per 10,000 unique, localized insertions: i.e., percentages × 100. The numbers of chromosomes used in the calculations were as follows: BG, 2000; KG, 8000; EY, 8000; PA/PC, 1000. Complete hotspot data are available on request.